DISEASE PREDICTION
疾病预测
选择自己的数据或 Demo 数据,运行后查看单个样本结果。
01 · YOUR DATA
登录并上传数据
登录后上传基因型文件及模型需要的基础信息。您的数据会固定显示在下方列表第一行。
数据类型与文件要求
以下列明数据文件类型及相应提交规范。提交数据须符合对应的文件结构、样本标识与质量要求。
VCF / BCF 基因型文件
- 文件:
.vcf、BGZF 压缩的.vcf.gz或.bcf。 - 须包含样本标识、变异位点和基因型;VCF 的
FORMAT中包含GT,例如0/1、0|1。不能只提供变异坐标列表。 - VCF 使用 UTF-8、VCF 4.2 / 4.3、Tab 分隔;单样本共 10 列,POS 为正整数,版本及参考声明不重复,无空行,单行含换行不超过 1,048,576 个字符。
基因型表格与结构化文件
- 文件:CSV/TSV 等分隔文本、
.xlsx、JSON/XML、JSONL、Parquet。Excel 不接受旧版.xls。 - 提供染色体、位置及基因型,如 CHROM/POS 与 AG 或 GT;以 rsID 标识位点时也必须有基因型。只有 rsID 或坐标、没有基因型的文件不符合要求。
- 明确列名、样本身份和编码含义;数值 0/1/2 须注明计数的等位基因,不将连续概率 dosage 当作硬调用。表格不依赖公式计算;多工作表须明确数据所在工作表。
PLINK 基因型文件组
- 文件:配套的
.bed+.bim+.fam,三个文件缺一不可,文件名前缀一致。 - BED 为 SNP-major 格式;BIM 中的位点和 FAM 中的样本须与 BED 对应。其他 PLINK 文件组合不在本项范围内。
- 提供参考版本、样本标识及已知链方向;多人数据须明确需要分析的个人。
FASTQ 原始测序文件
- 文件:
.fastq/.fq,或其 gzip/BGZF、bzip2、xz 压缩文件。 - 单端提供一个文件;双端提供同一个人的 R1、R2 两个文件。双端两个文件代表一个人,不能当作亲缘比较的两个人。
- 数据须为人类胚系短读长 DNA、Phred+33、四行 FASTQ;注明 WGS、WES 或 panel,WES/panel 配套提供 GRCh38 目标区域 BED。
- 不同人的文件须明确分组并标注样本身份。不接收 RNA、长读长、肿瘤体细胞、混样或需要 UMI 专门处理的数据。
所有数据都需要满足的要求
- 已有基因型数据须明确参考版本:GRCh38 / hg38 或 GRCh37 / hg19。版本须来自原始数据说明,不可仅修改版本声明;未知版本或信息冲突需先确认。
- 每个人有明确样本标识,不混淆人数与文件数。疾病、表型、基因 GPS 每次选择一个人;亲缘比较选择两个不同的人。
- 模型采用 1–22 号常染色体、二倍体、双等位 SNP;X/Y/MT、indel、多等位等不用于当前模型分析。缺失如实标注,不补成 0/0。
- 年龄、性别选填;填写年龄支持 18–100 岁。同一份已就绪个人数据可用于多个模型,无需重复上传。
- 不设账户累计上传额度。文件仍须符合上传表单的大小与数量要求,并通过质量检查;接收成功不代表分析一定通过,位点覆盖率不等于预测准确率。
疾病、表型和基因 GPS:选择一个人的数据。亲缘推断:分别上传并选择两个人的数据,也可使用参考样本。
个人数据入口登录后开放文件上传与任务记录登录 / 注册 →DATASETS
选择本次运行的数据
一次运行一个样本。登录数据始终排在 Demo 之前。
Demo 使用已完成结果,本页不会重新进行模型推断。
正在载入结果0%
正在准备所选样本的正式模型结果。
SELECTED RESULT
Demo 01
结果说明
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